Situado sobre la necrópolis tardorromana de San Antón, que es probablemente la estructura que más carácter otorga al museo. Su colección de epigrafía funeraria es una de las mejores de España, así como la minería romana y las producciones cerámicas, fundamentalmente vajillas, que dan testimonio del intenso tráfico comercial que mantuvo el puerto a partir del siglo II a.C. En la escultura romana destacan el retrato de un niño con corona y el joven con clámide.